Постановлением Правительства РФ от 11 июля 1994 г. № 816 Центральному научно-исследовательскому институту химии и механики присвоен статус Государственного научного центра Российской Федерации (ГНЦ РФ). Статус ГНЦ РФ сохранён постановлением Правительства РФ от 14 июля 1997 г. № 880, распоряжениями Правительства РФ от 29 января 2000 г. № 159-р, от 20 февраля 2002 г. № 218-р, от 31декабря 2004 г. № 1769-р, от 23 января 2007 г. № 40-р, от 28 февраля 2009 г. № 252-р.

По своей основной деятельности ГНЦ РФ ФГУП "ЦНИИХМ" имеет лицензии и сертификаты:

• лицензия Федеральной службы по экологическому, технологическому и атомному надзору на осуществление деятельности по применению взрывчатых материалов промышленного назначения от 07 февраля 2008 г. № ПВ-00-008386 (В);
• лицензия Министерства РФ по делам ГО и ЧС и ликвидации последствий стихийных бедствий на осуществление производства работ по монтажу, ремонту и обслуживанию средств обеспечения пожарной безопасности зданий и сооружений от 2 октября 2007 г. № 2/21459;
• лицензия Министерства обороны Российской Федерации на деятельность в области создания средств защиты информации от 04 августа 2008 г. № 499;
• лицензия Федеральной службы по надзору в сфере образования и науки на осуществление деятельности по образовательным программам, указанным в приложении к лицензии, при соблюдении зафиксированных в нем контрольных нормативов и предельной численности контингента обучающихся воспитанников от 24.10.2007 г. № 9439;
• сертификат соответствия от 19 июня 2006 г. № 00168/RU, который удостоверяет, что система менеджмента качества применительно к комплексному проектированию в области строительства зданий, сооружений и инженерных сетей объектов промышленного и гражданского назначения, работам по стандартизации продукции (код ОК-029-2001:74.20) соответствует требованиям ГОСТ Р ИСО 9001-2001;
• сертификат соответствия от 19 июня 2006г. № 00169/RU, который удостоверяет, что система менеджмента качества применительно к интеллектуальной продукции и услугам по исследованиям и разработкам в области безопасности промышленных объектов) соответствует требованиям ГОСТ Р ИСО 9001-2001;
• свидетельство о регистрации от 17 апреля ВР СР.8.08.0055-2008, которое удостоверяет, что предприятие ФГУП "ЦНИИХМ" зарегистрировано, наделено полномочиями и правом проведения работ в Системе добровольной сертификации <Военный регистр> в качестве Учебного центра;
• аттестат аккредитации органа по аттестации для проведения аттестации объектов информатизации от 13.12.2006 г. № СЗИ RU/1888.В961.252.